Trường Đại học Phương Đông thực hiện nhiệm vụ đào tạo bậc đại học và sau đại học hệ chính quy trong các lĩnh vực trọng điểm: Kinh doanh và quản lý, Kỹ thuật và công nghệ, Khoa học xã hội và nhân văn, Kiến trúc và xây dựng. Hiện nay, Nhà trường đang tổ chức đào tạo với 16 ngành: Thương mại điện tử, Công nghệ thông tin, Truyền thông đa phương tiện, Quản trị kinh doanh, Quản trị kinh doanh dịch vụ du lịch và lữ hành, Quản trị văn phòng, Kế toán, Tài chính – Ngân hàng, Ngôn ngữ Anh, Ngôn ngữ Trung Quốc, Ngôn ngữ Nhật Bản, Kiến trúc, Kỹ thuật xây dựng, Kinh tế xây dựng, Công nghệ kỹ thuật điện – điện tử, và Công nghệ kỹ thuật cơ điện tử. Đây là những ngành học đáp ứng trực tiếp nhu cầu nhân lực của nền kinh tế hiện đại, gắn liền với xu hướng phát triển trong kỷ nguyên số và hội nhập quốc tế.
Các chương trình đào tạo của Trường được xây dựng trên cơ sở chuẩn chương trình đào tạo quốc gia, đồng thời tham chiếu các chuẩn mực khu vực và quốc tế, kết hợp với nhu cầu thực tiễn xã hội. Nội dung đào tạo chú trọng sự gắn kết giữa lý thuyết và thực hành, giữa kiến thức nền tảng và kỹ năng nghề nghiệp, giúp sinh viên hình thành năng lực toàn diện để sẵn sàng thích ứng với môi trường lao động trong nước và quốc tế.
Nhà trường hướng tới đào tạo nguồn nhân lực có phẩm chất chính trị, đạo đức và nhân cách tốt; có tri thức chuyên môn sâu rộng; có năng lực thực hành nghề nghiệp tương xứng với trình độ đào tạo. Sinh viên sau khi tốt nghiệp không chỉ đáp ứng được yêu cầu của thị trường lao động mà còn có khả năng khởi nghiệp, tự tạo việc làm, hợp tác bình đẳng trong môi trường toàn cầu. Văn bằng do Trường Đại học Phương Đông cấp thuộc hệ thống văn bằng quốc gia, có giá trị pháp lý và xã hội.
Song song với việc đào tạo kiến thức chuyên môn, Nhà trường chú trọng phát triển kỹ năng mềm, kỹ năng số, tư duy phản biện, sáng tạo và năng lực ngoại ngữ để sinh viên tự tin hội nhập quốc tế. Hoạt động nghiên cứu khoa học, thực tập tại doanh nghiệp, khởi nghiệp và trao đổi quốc tế được tích hợp vào quá trình đào tạo, giúp người học tích lũy kinh nghiệm thực tiễn ngay từ khi còn ngồi trên ghế nhà trường.
Bên cạnh đó, Trường Đại học Phương Đông đẩy mạnh hợp tác trong đào tạo, nghiên cứu và chuyển giao công nghệ với các doanh nghiệp, tổ chức và trường đại học trong và ngoài nước. Đây là cơ sở quan trọng để nâng cao chất lượng đào tạo, đồng thời mở rộng cơ hội việc làm, nghiên cứu và hội nhập quốc tế cho sinh viên.